南京海事法院是全国第11家海事法院，管辖区域为江苏沿海海域和长江水道通海水域。南京海事法院内设综合办公室、政治部（督查室）、立案庭（诉讼服务中心、审判监督庭）、海事审判庭、海商审判庭、执行局（执行指挥中心）、司法警察支队、机关党委。为方便当事人诉讼，还分别在辖区内的连云港、南通、泰州、苏州四个城市设立了派出法庭。

南京海事法院管辖范围为：自江苏省与山东省交界处至江苏省与上海市交界处的延伸海域，自江苏省与安徽省交界处至江苏省浏河口之间长江干线及支线水域，以及江苏省行政区域内的港口与通海可航水域...